Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R42Q7Z4L9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms