Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUP54Q7Z3B4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms