Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEND4Q6ZU67 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms