Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBR3Q6ZT12 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms