Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CAPN12Q6ZSI9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms