Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms