Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC174Q6PII3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms