Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CSAG1Q6PB30 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms