Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDC4Q6P2E9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC4Q6P2E9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms