Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms