Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms