Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms