Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms