Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC27Q2M243 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms