Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
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