Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms