Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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