Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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PDK4Q16654 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDK4Q16654 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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