Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms