Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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VAMP3Q15836 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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VAMP3Q15836 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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