Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms