Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK3Q15120 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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