Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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