Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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