Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFIXQ14938 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms