Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSPNQ14714 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms