Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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