Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 GUK1-219ENST00000470040 2548 ntTSL 216.37■□□□□ 0.213e-7■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.444e-12■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CDC123-209ENST00000498747 890 ntTSL 315.89■□□□□ 0.134e-12■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CDC123-204ENST00000440613 685 ntTSL 511.07□□□□□ -0.644e-12■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.813e-8■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.123e-8■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 WIPI2-209ENST00000479690 824 ntTSL 220.63■□□□□ 0.893e-8■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.683e-8■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 WIPI2-207ENST00000471851 2523 ntTSL 214.74□□□□□ -0.053e-8■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 BTF3-204ENST00000508901 954 ntTSL 27.52□□□□□ -1.216e-54■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 BTF3-203ENST00000507081 377 ntTSL 55.79□□□□□ -1.486e-54■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.993e-8■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.942e-6■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.892e-6■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.562e-6■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.154e-6■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 SNHG6-205ENST00000521399 302 ntTSL 224.92■■□□□ 1.584e-10■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 VTI1B-201ENST00000216456 1103 ntTSL 1 (best)26.84■■□□□ 1.894e-8■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-6■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 IPO9-202ENST00000456707 609 ntTSL 310.46□□□□□ -0.733e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 VTI1B-206ENST00000556461 576 ntTSL 29.72□□□□□ -0.854e-8■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.553e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.373e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.931e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.91e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.241e-46■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 CIZ1-212ENST00000471773 717 ntTSL 29.25□□□□□ -0.937e-9■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 SLC7A8-204ENST00000422941 3018 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.431e-6■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 SLC7A8-201ENST00000316902 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.561e-6■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 SLC7A8-203ENST00000397310 2719 ntTSL 210.94□□□□□ -0.661e-6■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.911e-6■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 SLC7A8-202ENST00000339733 3066 ntTSL 1 (best)9.09□□□□□ -0.951e-6■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRKAR2A-205ENST00000438535 624 ntTSL 310.7□□□□□ -0.71e-21■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRKAR2A-204ENST00000437821 627 ntTSL 57.8□□□□□ -1.161e-21■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 CCNB2-205ENST00000621385 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.972e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 AC092757.2-201ENST00000559026 633 ntTSL 4 BASIC8.91□□□□□ -0.982e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 24.4□□□□□ -1.711e-36■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 RPL18-215ENST00000552705 1081 ntTSL 215.41■□□□□ 0.061e-46■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.043e-6■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.043e-6■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.043e-6■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 DGUOK-203ENST00000418996 703 ntTSL 1 (best)19.16■□□□□ 0.663e-6■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.922e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.672e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 02e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.872e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.172e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.22e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.742e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.742e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.993e-9■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 RPS20-203ENST00000519369 824 ntTSL 216.17■□□□□ 0.182e-35■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 RPS20-209ENST00000521289 737 ntTSL 513.58□□□□□ -0.242e-35■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.022e-35■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 YIF1B-210ENST00000589151 431 ntTSL 218.15■□□□□ 0.51e-11■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 ISOC2-208ENST00000591718 786 ntTSL 219.86■□□□□ 0.772e-9■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -06e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.076e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.058e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.118e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 SUCLG1-205ENST00000484365 1765 ntTSL 28.44□□□□□ -1.063e-6■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.024e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.044e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.544e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 RPL18-202ENST00000546623 541 ntTSL 519.14■□□□□ 0.653e-49■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.52e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.15e-10■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 AP1M1-205ENST00000586543 642 ntTSL 513.85□□□□□ -0.195e-10■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.175e-10■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.192e-6■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 NPRL3-210ENST00000610509 2917 ntTSL 214.3□□□□□ -0.122e-6■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 VIM-203ENST00000469543 2666 ntTSL 221.17■□□□□ 0.981e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.841e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 VIM-209ENST00000544301 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)19.91■□□□□ 0.781e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 VIM-206ENST00000487938 2272 ntTSL 519.77■□□□□ 0.751e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.482e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.462e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRR5-205ENST00000431834 1612 ntTSL 534.3■■■■□ 3.082e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.22e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.132e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRR5-208ENST00000455389 1431 ntTSL 320.88■□□□□ 0.932e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.922e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.882e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRR5-211ENST00000475850 1965 ntTSL 220.5■□□□□ 0.872e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRR5-207ENST00000432916 1430 ntTSL 219.96■□□□□ 0.792e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.562e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.42e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRR5-215ENST00000495017 2125 ntTSL 1 (best)17.17■□□□□ 0.342e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRR5-ARHGAP8-204ENST00000515632 1590 ntTSL 216.97■□□□□ 0.312e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PRR5-ARHGAP8-203ENST00000495250 1271 ntTSL 216.38■□□□□ 0.212e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 PABPC4-216ENST00000492468 2257 ntTSL 215.87■□□□□ 0.131e-11■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 PABPC4-206ENST00000437136 876 ntTSL 515.12■□□□□ 0.011e-11■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 PABPC4-213ENST00000482028 633 ntTSL 214.33□□□□□ -0.121e-11■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 PABPC4-209ENST00000468476 3592 ntTSL 29.86□□□□□ -0.831e-11■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 CFAP97-202ENST00000458385 4852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.491e-8■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.633e-8■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 DCUN1D5-204ENST00000527576 790 ntTSL 528.06■■■□□ 2.084e-7■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 DCUN1D5-208ENST00000529294 727 ntTSL 315.41■□□□□ 0.064e-7■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 ATP6V0B-206ENST00000472277 536 ntTSL 322.44■■□□□ 1.188e-11■■■□□ 16.7
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