Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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TRAF1Q13077 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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TRAF1Q13077 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
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TRAF1Q13077 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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TRAF1Q13077 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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TRAF1Q13077 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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