Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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