Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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KCNMA1Q12791 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNMA1Q12791 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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KCNMA1Q12791 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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KCNMA1Q12791 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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KCNMA1Q12791 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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KCNMA1Q12791 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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KCNMA1Q12791 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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