Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNG1Q06432 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms