Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms