Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNC4Q03721 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms