Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CAV1Q03135 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAV1Q03135 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms