Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms