Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA5Q01523 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA5Q01523 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms