Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSG4Q00888 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms