Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms