Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms