Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX1P78337 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX1P78337 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX1P78337 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX1P78337 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX1P78337 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX1P78337 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX1P78337 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX1P78337 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PITX1P78337 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PITX1P78337 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PITX1P78337 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PITX1P78337 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PITX1P78337 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX1P78337 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms