Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLF3P57682 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms