Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPTEP56180 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPTEP56180 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPTEP56180 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms