Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR4P51571 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR4P51571 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSR4P51571 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSR4P51571 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSR4P51571 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSR4P51571 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSR4P51571 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSR4P51571 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSR4P51571 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSR4P51571 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSR4P51571 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSR4P51571 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSR4P51571 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSR4P51571 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSR4P51571 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms