Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DAP3P51398 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms