Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTPAP49638 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTPAP49638 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTPAP49638 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTPAP49638 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTPAP49638 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTPAP49638 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTPAP49638 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTPAP49638 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTPAP49638 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTPAP49638 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTPAP49638 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TTPAP49638 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTPAP49638 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TTPAP49638 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTPAP49638 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTPAP49638 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTPAP49638 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTPAP49638 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTPAP49638 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTPAP49638 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms