Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRT6CP48668 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms