Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms