Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCKBRP32239 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCKBRP32239 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms