Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB2P29033 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB2P29033 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJB2P29033 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJB2P29033 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJB2P29033 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB2P29033 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms